律师解析：
向慈善机构捐款100万可以直接免税的，假如你企业年缴纳100万，这项捐款只影响你企业综合税负，税务部门查账征收，100万是减税部分，其余部分是应税额的基数。向税务部门说明时捐款要有收据或者受捐方的证明。
【法律依据】：
《中华人民共和国个人所得税法》 第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
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