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双向柱形图-BioLadder云平台(十二)

发布网友 发布时间:2天前

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热心网友 时间:2天前

大家好!我是BioLadder生物信息在线可视化云平台的工程师小宇,今天我来给大家分享怎样用BioLadder画出常用的双向柱形图!

什么是双向柱形图?双向柱状图(又名正负条形图),使用正向和反向的柱子显示类别之间的数值比较。其中分类轴表示需要对比的分类维度,连续轴代表相应的数值。其实就是由两个不同数据系列的柱形图组成的。

在组学数据分析中,双向柱形图可以很直观的看到,上下调蛋白,注释到该通路下的数量。

当然双向柱形图的作用不止如此,下面让我们一起来看看双向柱形图该怎么画吧。

绘图前的数据准备:demo数据可以在 bioladder.cn/shiny/zyp/...下载。包含3列数据,第一列为每个柱子的名字,第二列为第一个方向上的数值,第三列为第二个方向上的数值。

BioLadder生信云平台在线绘制双向柱形图:网址: bioladder.cn/web/#...

1. 上传文件:点击“选择”按钮上传自己的文件

2. 调整参数:根据需求调整参数即可

3. 提交查看:上传完数据,并调好参数后,点击右上方“提交”按钮,图像会出现在左侧。如果没有上传自己的数据,会使用默认的demo数据绘图。

4. 下载:可以直接点击下载按钮,快捷下载当前所看到的图形。也可以点击更多选项,对图片的宽高,格式等做调整。更多选项里,可以手动拖拽调整图片大小,也可以在下方的输入框内直接输入想要的大小,支持下载PNG,PDF,SVG,JPEG,BMP,EPS,TIFF等多种格式。

BioLadder生物信息在线分析可视化云平台:网址: bioladder.cn/

BioLadder目前上线了生物学分析最常用的50多个模块,主要包括以下四类:数据可视化,组学数据分析,功能分析,数据预处理。

数据可视化:箱线图,南丁格尔玫瑰图,韦恩图,UpSet图,饼图,词云图,小提琴图,双向柱形图,弦图,柱形图等

组学数据分析:序列的多重比对,表达数据的CV曲线图,双向柱形图,T-SNE,热图,相关性热图等,趋势分析的mFuzz,差异分析的火山图,富集分析的气泡图,修饰位点上下游模体分析的seqLogo,Motif热图等

功能分析:GO弦图,相互作用网络图,富集分析

数据预处理:归一化,补值,FDR校正,长宽表互换等

好了双向柱形图的绘制就到这里了,后续大家想要了解什么内容可以给我们评论反馈,我们会根据大家的意见持续更新。我们欢迎您以任何方式提出您的优化意见,使BioLadder平台成为广大科研工作者的生物信息分析首选平台!

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