如何从氨基酸顺序预测蛋白质功能？

发布网友 发布时间：2022-04-20 02:58

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热心网友 时间：2023-10-18 15:42

一、根据自己所掌握的样品物种来源，并将该序列拿到NCBI上去blast一下，如果有相似的序列，则能大概猜测其本质。
二、在心里有个底之后，再把这个序列拿到swiss-model上进行在线的免费同源建模（如果前一步的相似性太低的话，这一步就不要做了，一般认为，同源性至少要超过30%还是20%才有建模的意义）。
三、如果建得了模型，swiss-model会给出建模所参考的模版的编号，你可以用这个编号在pdb数据库中搜索相应的蛋白质结构。
四、如果该蛋白的活性中心已经被人们研究得知的话，那么比对你的序列和模版序列相似的区段的话，你就可以大致判断你的这段序列是否可能存在潜在的功能

热心网友 时间：2023-10-18 15:42

一、将该序列拿到NCBI上去blast一下，如果有相似的序列，则能大概猜测其本质。
二、在心里有个底之后，再把这个序列拿到swiss-model上进行在线的免费同源建模（如果前一步的相似性太低的话，这一步就不要做了，一般认为，同源性至少要超过30%还是20%才有建模的意义）。
三、如果建得了模型，swiss-model会给出建模所参考的模版的编号，你可以用这个编号在pdb数据库中搜索相应的蛋白质结构。
四、如果该蛋白的活性中心已经被人们研究得知的话，那么比对你的序列和模版序列相似的区段的话，你就可以大致判断你的这段序列是否可能存在潜在的功能。

热心网友 时间：2023-10-18 15:43

先分解成单个氨基酸，然后从单个氨基酸可以知道整个氨基酸序列的性质

热心网友 时间：2023-10-18 15:43

你可以到pdb里面搜索一下，有一些基本的信息，如果要查看特定的性质，有一些特定的软件可以预测。